C'était dans l'air du temps depuis de longues semaines. A peine revenu de son prêt à Valenciennes, Baptiste Aloé nous expliquait qu'il avait de grandes chances de s'engager définitivement dans le Nord, non sans s'être libéré de sa dernière année de contrat avec l'OM (vous pouvez retrouver l'intégralité de l'interview dans la vidéo). Malgré un intérêt du Bursaspor de Paul Le Guen, tout se passe donc comme prévu pour lui, qui a déjà joué près de 50 matchs avec la formation de Ligue 2 sur les deux dernières saisons en prêt.
Apparu pour la première fois avec Elie Baup en 2012, qui l'avait titularisé arrière droit pour un match d'Europa League contre Limassol au Vélodrome (5-1), Baptiste Aloé a disputé 15 matchs avec son club formateur en compétitions officielles. C'est Marcelo Bielsa qui lui a offert une exposition en Ligue 1 avec 14 matchs en 2014-2015 dont 4 titularisations et un but, à Toulouse.